2006年，为配合NDS版（钻石、珍珠版）的上市，TV动画同步推出全新系列《神奇宝贝钻石 珍珠》（Pokémon Diamond Pearl，简称DP）。对战开拓区篇结束后，小遥为了独自挑战城都地区的华丽大赛和小智告别，小胜回到了橙华道馆，小刚也回家去了。小智则受到了小茂的激励，独自带着皮卡丘和偷渡的长尾怪手前往神奥地区挑战联盟。 新登场的女主角小光，其蓝本取自电玩NDS版。为了成为顶尖协调训练家，小光从家乡双叶镇来到了位于真砂镇的山梨研究所领取最初的神奇宝贝。而同一时间，小智也抵达神奥地区，并在那里和小刚再度会合。机缘巧合，小光救了被火箭队抓走的皮卡丘，三人就一同结伴旅行，展开了新的旅程。 《神奇宝贝珍珠 钻石》每周四在日本首播。台湾也由中视进行转播，网络上能够找到前105集的国语配音。
演员：寺岛拓笃 小松未可子 钉宫理惠 手冢弘道 井泽诗织 青木志贵 安野希世乃 藤井雪代 高尾奏音 泽城美雪 岩田光央 大原沙耶香 大塚芳忠 浪川大辅 新祐树 楠大典 园崎未惠 井上穗乃花 新井里美 井上喜久子 小坂井祐梨绘
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演员：岛崎遥 卷口久美子 藤原明里 成田剑 铃木胜美 原泽晃绮 加势田进 横田荣治 北原冬子 红井秀之 鹤冈聪 松尾贵司 一条和矢 松浦有希子 七绪春日 藤田圭宣 川中子雅人 村井厚之 池田克成 小泉理奈 山口克子 浅子惠 鹤冈聪美 斋贺光希 千叶进步 佐野崇 栗原美纪子 铃木千寻 内藤玲 上野悟 平野智惠 武本和广 永山明美 内田顺子 松本梨香
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